學院前身是始建于1948年的黑龍江機械制造學校和黑龍江省畜牧獸醫(yī)學校；2002年10月，以黑龍江機械制造學校與黑龍江經濟管理干部學院為基礎，成立黑龍江工商職業(yè)技術學院；2010年，黑龍江畜牧獸醫(yī)職業(yè)學院更名為黑龍江科技職業(yè)學院；2012年經省政府批準，由黑龍江工商職業(yè)技術學院與黑龍江畜牧獸醫(yī)職業(yè)學院合并組建黑龍江職業(yè)學院。